Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL4Q9C0H6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms