Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms