Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSBP4Q9BWG4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms