Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms