Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms