Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms