Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms