Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms