Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC42Q96M95 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC42Q96M95 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms