Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms