Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms