Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC136Q96JN2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms