Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A3Q96HJ5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms