Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms