Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPNQ96H22 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms