Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms