Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEIL1Q96FI4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms