Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms