Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms