Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms