Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB13Q92826 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms