Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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