Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH0

SYNE2, Nesprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 6,885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE2Q8WXH0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE2Q8WXH0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms