Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms