Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms