Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KBTBD3Q8NAB2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms