Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms