Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC117Q8IWD4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC117Q8IWD4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms