Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDKL3Q8IVW4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKL3Q8IVW4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms