Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHA9Q7RTU4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHA9Q7RTU4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms