Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX46

ALKAL2, ALK and LTK ligand 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL2Q6UX46 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ALKAL2Q6UX46 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms