Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms