Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms