Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCTP1Q6DN14 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms