Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms