Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf135Q5VTT2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms