Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRMS1LQ5PSV4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms