Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms