Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms