Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TWISTNBQ3B726 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms