Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5B1Q2VPB7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5B1Q2VPB7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms