Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFX7Q2KHR2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX7Q2KHR2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms