Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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