Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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