Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCBQ16585 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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