Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACKR1Q16570 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms