Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP10Q15642 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP10Q15642 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms