Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF1AQ15573 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms