Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms