Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE3CQ15386 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3CQ15386 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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